1.基因染色体定位TBtools
Graphics-show gene on chr-第一个
文件准备:
①染色体长度信息
②基因位置信息
#①:染色体长度文件
用基因组序列提取每条染色体的长度信息,结果是NC_开头的基因组编号,不是染色体号
记录了每条染色体的长度信息。只要有基因组序列文件,可以使用 TBtools 的 Fasta Stat 直接生成一个。
Sequence Toolkit-Fasta Tools-Fasta Stats,勾选keep only
(1)基因组序列文件,Fasta格式
(2)输出的染色体长度信息:ChrLen.tab.txt-两列-第一列把NC改为LG系列 NC_:完整的基因组分子序列,标记的类别包括基因组、染色体、细胞器、质粒。
基因染色体定位图的调节
chr Label Font:染色体标签设置
Gene Label Font:基因标签设置
chr Bar Color:染色体内部的颜色
chr Bar Border:染色体外边框
1.基因染色体定位TBtools怎么让染色体标签在上面,而不是在在左边。
用TBtools做基因染色体定位图,怎么让染色体标签在上面,而不是在在左边。
点击:下面是方块,上面是圆圈。
问题
1.染色体旋转
2.基因字体颜色设置
3.加横的标签。
4.上边界的距离怎么增加些。不用
答:
1.点染色体标签,把圆圈放平。
2、3②group elements组元素
1.elements editor元素编辑器
①curr,element当前,元素
delete elenment:删除元素,不选
fill collor:选null
Boarder Color边框颜色:选择黑色,selected
fill Alpha:不懂
Boarder Stroke
Rotate Angle旋转角度
element type元素类型
gradient type渐变型
Z-Rank
②group elements组元素
③selected elements选定的元素
2.panel editor面板编辑器merge selected panels合并选定的面板
merge all panels
polar panel