GoSemSim函数具体用法

GOSemSim软件包提供了六个功能。功能goSim ， mgoSim ，geneSim 和clusterSim 可以计算语义GO词条，GO词条集，GO的描述之间的相似性基因产物和基因簇的GO描述。

1：mgeneSim 和mclusterSim函数旨在计算一组基因和基因簇的相似性得分矩阵。基本函数goSim的输出值在0到1之间。获得的值越高，它们之间的相似度越高
举例：

goSim("GO:0004022","GO:0005515",semData = d,measure="Wang")
[1] 0.158

ps 前提必须引入数据集

2：函数mgoSim旨在计算两个相似度GO术语列表，例如
The function mgoSim is designed to compute the similarity of twoGO terms lists, such a

 go1=c("GO:0004022","GO:0004024","GO:0004174")
> 
> go2=c("GO:0009055","GO:0005515")
> mgoSim(go1, go2,semData = d,measure="Wang")
[1] 0.192
>