U盘一般是FAT32、NTFS，或者exFAT。
FAT32最大支持4G的文件，最大容量是2T。
NTFS是现在Windows应用最广泛，也是最好的文件格式，最大可支持16EB。
exFAT微软为闪存U盘专门设计的，最大支持16EB，一般说是最适合U盘的格式，他比NTFS简单，同时也比FAT32支持的文件大。
论兼容性，FAT32基本上能支持所有的新老机型，所以做启动盘还是建议使用这个；
NTFS是针对机械硬盘设计的，会记录详细的硬盘读写操作，因此对于闪存会有很大的负担和伤害，容易影响寿命。闪存储存芯片读写次数是有限的，使用日志式文件系统的话，意味着所有对磁盘的操作都要记录日志。大量的小文件读写对于U盘的伤害是极大的，会缩短U盘寿命。
如果是正常使用，建议使用exFAT。（闪存推荐使用exFat）