首页 > 技术文章 > PCR | qPCR | RT-PCR 的原理及应用

leezx 2019-06-10 13:13 原文

生物的东西必须要主动去了解,否则视野容易受到限制,尤其是分子生物学的核心技术。

 

PCR - 聚合酶链式反应

The Complete Guide to PCR (How it Works, Primer Design, and Running Reactions) - YouTube

目的:从DNA双链中扩增出感兴趣的区段,用于后续的研究。

原理:DNA结构,双螺旋,AT、GC配对;DNA双链在临界温度会解链,退火后又会恢复;引物,DNA复制的起点,之所以需要引物是因为在DNA合成中DNA聚合酶只能把新的核苷酸加到已有的DNA链上。

操作核心:wiki上很全面

1. 引物设计,会考虑GC含量,决定退火温度;

2. 变性、退火和延伸;

 

PCR的应用 - PCR Applications—Top Seven Categories

  1. Gene expression
  2. Genotyping (detection)
  3. Cloning
  4. Mutagenesis
  5. Methylation analysis
  6. Sequencing
  7. Medical, forensic, and applied sciences

 

问题:

1.真核生物的组蛋白会影响PCR吗?

2.为什么需要前后引物,前后引物是如何p出指定区段的?

3.PCR、qPCR和RT-PCR之间的区别和联系?

 

PCR - 任何核酸序列

 

RT-PCR 逆转录聚合酶链式反应 - 分析的是RNA,大部分是基因表达

逆转录PCR,就是PCR的一个常规应用,我也跑过,见过庞大的机器,也是先设计引物,然后提cDNA,定量。

一条RNA链被逆转录成为互补DNA,再以此为模板透过PCR进行DNA复制。

PCA我们是扩增DNA序列,而RT-PCR我们扩增的是反转录出来的cDNA序列,然后再做PCR,把量做上去来检测,通常会配上一些管家基因作为对照。

RT-PCR的数据分析可以参照Y数微信公众号,代码很详细。

 

qPCR (Quantitative Real-time PCR) 实时荧光定量PCR - 分析的是DNA

实时荧光定量PCR (Quantitative Real-time PCR)是一种在DNA扩增反应中,以荧光化学物质测每次聚合酶链式反应(PCR)循环后产物总量的方法。通过内参或者外参法对待测样品中的特定DNA序列进行定量分析的方法。

 


 

 

总结:

  • PCR是一切的鼻祖,即通过控制温度+底物原料,来复制核酸序列
  • RT-PCR,RT不是实时定量,而是反转录,第一步就是反转录,用于基因表达的检测,就是单基因的RNA-seq
  • qPCR,实时定量,我们常见的新冠核酸检测、肿瘤基因检测等,都是qPCR,看有没有指定核酸片段

 

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