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r - 将 R“tvReg”包安装到 HPC 集群

问题描述

我正在尝试在我的本地文件夹中安装一些软件包。我只是写

install.packages("tvReg" , repos = "http://cran.us.r-project.org")

在我的 R 脚本之上。结果似乎该软件包像其他软件包一样被安装，但是当我想使用它时

library(tvReg)

它显示一个错误，告诉您没有这样的包。

我检查了my-R-libs文件夹，安装后没有tvReg。我还尝试直接从 GitHub 链接https://github.com/cran/tvReg复制包文件，但这次错误表明这不是一个有效的包并将其从文件夹中删除。我想使用的所有其他软件包都正常工作，这是我唯一无法安装的软件包。

标签： rpackagesputtyhpc

解决方案

很可能，安装没有成功完成。该软件包依赖于许多其他软件包。尝试再次安装并注意最后几行。您应该看到以下几行：

** package 'tvReg' successfully unpacked and MD5 sums checked
** R
** data
*** moving datasets to lazyload DB
** inst
** byte-compile and prepare package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** installing vignettes
** testing if installed package can be loaded
* DONE (tvReg)

安装完成后，测试一下：

library("tvReg")
# Loading required package: Matrix
# Funded by the Horizon 2020. Framework Programme of the European Union.

您还可以执行以下命令：.libPaths(). 它将列出 R 将在其中搜索包的目录。您的用户目录应该在该列表中的第一位。安装 R 包时默认使用此目录。

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