simulation - 阅读 Ion Torrent 全外显子组测序模拟器
问题描述
我有一个对齐的 BAM 文件，我想模拟它以生成读取。我使用的平台是 Ion AmpliSeq Whole Exome Sequencing。我想知道是否有适用于 Ion Torrent 平台的读取模拟器。
解决方案
查看此出版物：高通量测序中使用的映射算法的比较：Ion Torrent 数据的应用，Caboche 等人。BMC 基因组学，2014，15：264。
他们的工具是CuReSim，还没用过，但我会试试的。也许它可以帮助你...
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