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r - 在 R 中使用 asIgraph() 函数将网络对象转换为 igraph 对象时出错？

问题描述

我目前正在尝试将网络对象转换为 igraph 对象。从各种帖子中，我了解到intergraph包可以通过该asIgraph()功能做到这一点。我正在尝试转换ergm包中的经典 Sampson 数据集。当我做：

> library(ergm)
> library(intergraph)
> library(igraph)
> data(sampson)
> class(samplike) # The network object
[1] "network"
> asIgraph(samplike)
Error in (function (..., row.names = NULL, check.rows = FALSE, check.names = TRUE,  : 
  arguments imply differing number of rows: 88, 26

我有上面的错误。有谁知道为什么这个规范数据集会失败？

标签： rigraph

解决方案

编辑：查看两周前在ergmGitHub 上发布的最新帖子修复了 sampson 数据集的“提名”属性。 这是 sampson 数据集中的一个错误，现已在 GitHub 版本上修复，但尚未更新到 CRAN。

它失败了，因为sampson数据集的边缘属性nominations只有 26 个值，即使数据集中有 88 条边。当intergraph尝试转换时，igraph它会尝试将边缘属性绑定到边缘列表，asDF()但此步骤失败。简单的事情是像这样删除边缘属性：

smplk<-samplike

delete.edge.attribute(smplk, "nominations")

asIgraph(smplk)

IGRAPH dca72f1 D--- 18 88 -- 
+ attr: cloisterville (v/l), group (v/c), na (v/l), vertex.names
| (v/c), na (e/l)
...

从文档中我有点不清楚这个属性应该如何映射到边缘列表，但如果可以确定它可以单独添加set.edge.attribute。

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