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r - 如果任何元素与任何其他行的元素匹配，则R组合矩阵行

问题描述

如果行中的至少一个值等于另一行中的值之一，我想将矩阵中的行组合成一个列表元素。并迭代地执行此行组合（所有行与所有其他行）。我很抱歉解释不好。一个例子来澄清：

mymatrix <- matrix(data = c(2, 3, 4, 22, 7, 11, 8, 13, 17, 19, 20,
                            4, 36, 8, 2, 29, 35, 40, 14, 21, 20, 21),
                   nrow = 11, ncol = 2)
row.names(mymatrix) <- c(3, 6, 7, 10, 12, 17, 18, 19, 24, 26, 28)

某些函数的结果应该是：

myresult <- list(c(2, 4, 4, 8, 22, 2, 8, 40),
                 c(3, 36),
                 c(7, 29),
                 c(11, 35),
                 c(13, 14),
                 c(17, 21, 20, 21, 19, 20))

因此，原始矩阵的第 1、3、4、7 行被合并（要清楚，行名为 3、7、10、18 的行），底部 3 行也是如此。

如果解决方案将删除每个列表元素中的重复项（和/或对整数进行排序）也很好，否则我会这样做。

在这种情况下，它看起来像这样：

myresult <- list(c(2, 4, 8, 22, 40),
                 c(3, 36),
                 c(7, 29),
                 c(11, 35),
                 c(13, 14),
                 c(17, 19, 20, 21))

也许我可以通过将矩阵与自身合并来实现这一点，但我不知道如何正确地做到这一点。帮助表示赞赏！

标签： r

解决方案

这是一个图聚类问题；您可以igraph为此使用包：

library(igraph)

# change the vertice name type to character
mode(mymatrix) <- 'character'

# create the graph
g <- graph_from_edgelist(mymatrix)

# find out the cluster
members <- clusters(g)$membership

# split nodes by membership
split(names(members), members)
#$`1`
#[1] "2"  "4"  "8"  "22" "40"

#$`2`
#[1] "3"  "36"

#$`3`
#[1] "7"  "29"

#$`4`
#[1] "11" "35"

#$`5`
#[1] "13" "14"

#$`6`
#[1] "17" "21" "19" "20"

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