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python - 使用 CUDA 进行希尔伯特变换

问题描述

为了对一维数组进行希尔伯特变换，必须：

我正在使用 PyCuLib 进行 FFTing。到目前为止我的代码

def htransforms(data):
    N = data.shape[0]
    transforms       = nb.cuda.device_array_like(data)          # Allocates memory on GPU with size/dimensions of signal
    transforms.dtype = np.complex64                             # Change GPU array type to complex for FFT 

    pyculib.fft.fft(signal.astype(np.complex64), transforms)    # Do FFT on GPU

    transforms[1:N/2]      *= 2.0      # THIS STEP DOESN'T WORK
    transforms[N/2 + 1: N]  = 0+0j     # NEITHER DOES THIS ONE

    pyculib.fft.ifft_inplace(transforms)                        # Do IFFT on GPU: in place (same memory)    
    envelope_function      = transforms.copy_to_host()          # Copy results to host (computer) memory
    return abs(envelope_function)

我有一种感觉，这可能与 Numba 的 CUDA 接口本身有关……它是否允许像这样修改数组（或数组切片）的各个元素？我认为它可能，因为变量transforms是 a numba.cuda.cudadrv.devicearray.DeviceNDArray，所以我想它可能有一些与 numpy's 相同的操作ndarray。

简而言之，使用 Numbadevice_arrays对切片进行简单操作的最简单方法是什么？我得到的错误是

*= 不支持的操作数类型：“DeviceNDArray”和“float”

标签： pythonsignal-processingnumba

解决方案

我会使用pytorch

您使用 pytorch 的函数（我删除了 abs 以返回复杂值）

def htransforms(data):
    N = data.shape[-1]
    # Allocates memory on GPU with size/dimensions of signal
    transforms       = torch.tensor(data).cuda()
    
    torch.fft.fft(transforms, axis=-1)
    transforms[:, 1:N//2]      *= 2.0      # THIS STEP DOESN'T WORK
    transforms[:, N//2 + 1: N]  = 0+0j     # NEITHER DOES THIS ONE

    # Do IFFT on GPU: in place (same memory)
    return torch.abs(torch.fft.ifft(transforms)).cpu()

但是您的转换实际上与我在维基百科上发现的不同

维基百科版本

def htransforms_wikipedia(data):
    N = data.shape[-1]
    # Allocates memory on GPU with size/dimensions of signal
    transforms       = torch.tensor(data).cuda()
    
    transforms = torch.fft.fft(transforms, axis=-1)
    transforms[:, 1:N//2]      *= -1j      # positive frequency
    transforms[:, (N+2)//2 + 1: N] *= +1j # negative frequency
    transforms[:,0] = 0; # DC signal
    if N % 2 == 0:
        transforms[:, N//2] = 0; # the (-1)**n term
    
    # Do IFFT on GPU: in place (same memory)
    return torch.fft.ifft(transforms).cpu() 

data = torch.zeros((1, 2**10))
data[:, 2**9] = 1;
tdata = htransforms(data).data;
plt.plot(tdata.real.T, '-')
plt.plot(tdata.imag.T, '-')
plt.xlim([500, 525])
plt.legend(['real', 'imaginary'])
plt.title('inpulse response of your version')

结果与您的定义

data = torch.zeros((1, 2**10))
data[:, 2**9] = 1;
tdata = htransforms_wikipedia(data).data;
plt.plot(tdata.real.T, '-');
plt.plot(tdata.imag.T, '-');
plt.xlim([500, 525])
plt.legend(['real', 'imaginary'])
plt.title('inpulse response of Wikipedia version')

维基百科定义的结果

您的版本1 + 1j * h[k]的h[k]脉冲响应是维基百科版本的脉冲响应。如果您使用的是真实数据，那么维基百科版本很好，因为您可以使用rfft和irfft生成一个线性版本

def real_htransforms_wikipedia(data):
    N = data.shape[-1]
    # Allocates memory on GPU with size/dimensions of signal
    transforms       = torch.tensor(data).cuda()
    transforms = -1j * torch.fft.rfft(transforms, axis=-1)
    transforms[0] = 0;
    return torch.fft.irfft(transforms, axis=-1)

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