r - 使用 zonal 命令进行加权平均计算
问题描述
我想知道每个类别的变量加权平均值(因为每个像素都有一个权重)。下面的代码不允许我做加权平均。任何建议将不胜感激!
#sample rasters
r <- raster(ncols=10, nrows=10)
category <- raster(ncols=10, nrows=10)
weight <- raster(ncols=10, nrows=10)
r[] <- runif(ncell(r)) * 1:ncell(r)
category[] <- runif(ncell(category)) * 1:ncell(category)
weight[] <- 1:ncell(weight)
#mean for each category
zonalstats <- zonal(r, z=category, fun='mean', digits=0, na.rm=TRUE, count=T)
解决方案
你可以使用这个功能。它适用zonal
于权重和栅格值,并计算加权平均值。
weightedZonalMean <- function(r, z, w, na.rm = TRUE, ...){
zonalvalues <- zonal(r, z=z, fun=function(x, na.rm){x}, na.rm, ...)
zonalweights <- zonal(w, z=z, function(x, na.rm){x}, na.rm, ...)
weigtedValues <- cbind(zonalvalues[,1],
sapply(1:nrow(zonalvalues), function(x){
stats::weighted.mean(x = zonalvalues[x, 2:ncol(zonalvalues)],
w = zonalweights[x, 2:ncol(zonalweights)])
}))
return(weigtedValues)
}
weightedZonalMean(r, z, w, digits = 0)
# [,1] [,2]
# [1,] 0 12.254438
# [2,] 1 0.487548
# [3,] 2 1.246249
# [4,] 3 17.283858
# [5,] 4 22.545906
# [6,] 5 29.388179
# [7,] 6 13.494853
# [8,] 8 1.592464
# [9,] 9 15.510155
# [10,] 10 10.091313
# ...