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python - 在 Python 3 环境中使用 f2py 时出现错误“需要类似字节的对象，而不是 'str'”

问题描述

我发现我在 python 3 环境中的 f2py 可能没有正确安装。因此，我尝试使用以下文件测试 f2py：

$vi forMatMul_ref.f90  
     subroutine matrixMult (C , A , B , n )
     implicit none
     integer , intent (in) :: n
     real *8 , intent (in) :: A (n , n )
     real *8 , intent (in) :: B (n , n )
     real *8 , intent ( out ) :: C (n , n )
     C = matmul (A , B )         
     return
     end subroutine matrixMultul_ref.f90

然后我在 IPYTHON 中测试文件：

import numpy as np
import numpy . f2py as f2py

fid = open ("forMatMul_ref.f90")    
source = fid.read()
fid.close()

f2py.compile(source, modulename = "forMatMul")
import forMatMul
AB =  forMatMul . matrixmult (A , B )

但是，运行 f2py 的编译过程时会出现错误，如下所示：

() 中的 TypeError Traceback (最近一次调用最后一次) ----> 1 f2py.compile(source, modulename='forMatMul')

/Users/HYF/anaconda/envs/py35/lib/python3.5/site-packages/numpy/f2py/__init__.py in compile(source, modulename, extra_args, verbose, source_fn, extension)
     57 
     58     try:
---> 59         f.write(source)
     60         f.flush()
     61 

/Users/HYF/anaconda/envs/py35/lib/python3.5/tempfile.py in func_wrapper(*args, **kwargs)
    481             @_functools.wraps(func)
    482             def func_wrapper(*args, **kwargs):
--> 483                 return func(*args, **kwargs)
    484             # Avoid closing the file as long as the wrapper is alive,
    485             # see issue #18879.

TypeError: a bytes-like object is required, not 'str'

此处提供了一些基本信息： 

## Computer OS
Darwin I.local 14.3.0 Darwin Kernel Version 14.3.0: Mon Mar 23 11:59:05 PDT 2015; root:xnu-2782.20.48~5/RELEASE_X86_64 x86_64 i386 MacBookAir7,2 Darwin
## Python environment
/Users/HYF/anaconda/envs/py35/bin/python
## Fortran compiler (GCC 4.9.4 contains both C and Fortran compiler)
Using built-in specs.
COLLECT_GCC=gcc
COLLECT_LTO_WRAPPER=/usr/local/libexec/gcc/x86_64-apple-darwin14.0.0/4.9.2/lto-wrapper
Target: x86_64-apple-darwin14.0.0
Configured with: ../gcc-4.9-20141029/configure --enable-languages=c++,fortran
Thread model: posix
gcc version 4.9.2 20141029 (prerelease) (GCC) 
(py35)

我想就如何进行。

附言

我已经通过编辑 numpy/numpy/f2py/ 中的 _init_py 解决了这个问题。

标签： pythonpython-3.xnumpyfortranf2py

解决方案

尝试以二进制模式打开文件open("forMatMul_ref.f90", "rb")- 它会为您提供源代码的原始字节（这似乎是它所期望的），而不是解码为字符串。这可能是他们将遗留的 python 2 代码移植到 python 3 中运行的副作用，否则字符串对象似乎是源代码的适当表示。如果您有兴趣，这篇文章描述了 Python 2 和 3 之间字符串的变化：https ://timothybramlett.com/Strings_Bytes_and_Unicode_in_Python_2_and_3.html

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