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python - 在 python 中附加表（不同的行号）用于可视化目的

问题描述

我正在努力将以下表格简单地附加到一个表格中：

chr    pos    gene
1    100    A
2    150    B

chr    pos    gene
1    100    A
2    150    F
4    800    D

我希望决赛桌看起来像：

chr    pos    gene    chr    pos    gene
1    100    A    1    100    A
2    150    B    2    150    F
                4    800    D

这些表的列数相同，但行数不同。如果需要，可以使用 NaN 或 0 填充这些空白点。这只是为了让我们一次更好地直观地比较几个表文件。没有什么花哨的需要。

我尝试使用来自以下方法的 pandas：https ://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/merging.html但这里的方法会将具有相同索引的行组合在一起 - 我不需要。我也尝试只使用 csv.reader （如何两个与 python 水平合并几个 .csv 文件？），但我的输出是空的，没有错误消息......不确定是不是因为行数不同。

任何意见，将不胜感激。谢谢你。

标签： pythonpandascsv

解决方案

尽管它使这个数据帧很难用于以后的处理，但您可以使用pd.concat. 如果您的数据框被分别调用df1和df2：

>>> pd.concat((df1,df2), axis=1).replace(np.nan, '')
   chr  pos gene  chr  pos gene
0    1  100    A    1  100    A
1    2  150    B    2  150    F
2                   4  800    D

该replace调用只是为了获取空白字符串而不是NaN. 正如您在问题中所说，NaNs 是可以接受的，因此您可以省略它，只需使用：

>>> pd.concat((df1,df2), axis=1)
   chr    pos gene  chr  pos gene
0  1.0  100.0    A    1  100    A
1  2.0  150.0    B    2  150    F
2  NaN    NaN  NaN    4  800    D

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