r - 我可以使用 biomart 来绘制基因名称、省略号和染色体位置吗？

Question

我从一些文本中提取了有关对象中基因和染色体的信息，以对一些文本的数据库进行分类。

我的结果遗漏了一些信息；事实上，有些文本可能包含 justthe gene name and the location而我想得到omim number, the gene symbol, the gene name, and the chromosome location

这是我结果的一部分（使用 Rcode）

       OMIM   GENES_SYMBOL         GENES        CHROMOSOME
1      (NA)       (arlts1)         (NA)              (NA)
2      (NA)          (mtr)          (NA)              (NA)
3      (NA)        (hla.g)          (NA)              (NA)
4      (NA)  (nat2, t341c)          (NA)              (NA)
5  (222300)         (wfs1)          (NA)            (X4p16)

我想摆脱 NA：用等效的 nae 或代码替换每个；例如，获取arlts1并找到指定的 omim 编号、基因名称和染色体位置的东西。

我搜索了很多，但找不到包含所有信息的详尽数据库

可能我可以这样做biomart吗？我什至不知道有人可以帮助我解决我的问题吗？

标签： rbioinformaticsbiomart