wget - wget 下载 html 文件,但我需要一个 fasta 文件
问题描述
我必须在 NCBI 中搜索 ID CAA37914 并在 ubuntu-18.04 上使用 wget 下载 fasta 文件并将文件重命名为 CAA37914.fa。
我查了身份证,得到了以下网址:https ://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/CAA37914.1/?report=fasta
我尝试了以下方法:
wget https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/CAA37914.1/?report=fasta -O CAA37914.fa
但这没有用。我究竟做错了什么?
我得到一个带有 html 输出的文件
编辑:
我想我必须这样做:
wget “link/entrez/eutils/efetch.fcgi?db=nucleotide&id=NM_208885&retype=fasta” -O NP_983532_dna.fa
解决方案
我想到了。这是答案:
wget "http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi?db=nucleotide&id=CAA37914&rettype=fasta" -O CAA37914.fa
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