perl - 在 Windows 上安装 MUSCLE

Question

我想安装从http://www.drive5.com/muscle/downloads.htm下载的最新版本的 MUSCLE

命名为muscle3.8.31_i86win32.exe。正如指南 http://www.drive5.com/muscle/manual/install.html 所说，我必须在命令提示符下写下以下行：

C:\Program Files (x86)\muscle3.8.31_i86win32 -in seqs.fa -out seqs.afa

但是，我遇到了这个错误：

Robert C. Edgar 的肌肉 v3.8.31

http://www.drive5.com/muscle本软件捐赠给公共领域。请引用：Edgar, RC Nucleic Acids Res 32(5), 1792-97。

* 错误 * 无法打开 'seqs.fa' errno=2

我确定该文件存在于上述目录中，但我不知道为什么会发生这种情况以及如何修复它。任何想法？

标签： perlcmdinstallation

Answer 1

该程序报告操作系统报告该文件不存在。（这就是 errno 2 的含义。）

测试表明，亲属路径按预期相对于当前工作目录进行解析。

因此，您的操作系统说seqs.fa当前工作目录中没有命名文件。

仔细检查您拥有的文件的名称。请记住，文件资源管理器默认隐藏已知文件扩展名，因此使用dir会更可靠。