首页 > 解决方案 > 从 rstudio docker 内部连接到主机 mysql 数据库

问题描述

我已经使用 Rocker 图像将 Rstudio 设置为服务器上的容器。我的 MySQL 实例不在 docker 中,而是在主机上运行。db 是一个生产数据库——因此也不可以选择 dockerise db。

我可以从运行 RStudio 的 docker 容器内连接到主机 MySQL 吗?RStudio 容器运行完美,只是当我尝试连接到“外部”MySQL 以将数据写入数据库时​​,我遇到了问题。

目前正在尝试R最后挂起:

library(RMySQL)
library(DBI)
  db_user <- Sys.getenv("server_user")
  db_password <- Sys.getenv("server_pass")
  db_host <- '172.17.0.1' # docker ip
  db_dbname <- "test"

  mydb <-
    dbConnect(
      MySQL(),
      user = db_user,
      password = db_password,
      dbname = db_dbname,
      host = db_host, 
      port = 3306
    )
Error in .local(drv, ...) : 
  Failed to connect to database: Error: Can't connect to MySQL server on '172.17.0.1' (107)

更新,破解解决方案:

为了让容器与所有端口映射一起运行,我最终向 iptables 添加了一条规则并连接到数据库,就好像我从另一台服务器连接到它一样:

sudo iptables -I INPUT 5 -p tcp -s 172.17.0.2 --dport 3306 -m conntrack --ctstate NEW,ESTABLISHED -j ACCEPT -m comment --comment "docker DB access"

我还在 MySQL 中创建了一个可以访问数据库的特殊 docker 用户:

CREATE USER 'docker'@'172.17.0.2' IDENTIFIED BY 'XXX';
GRANT SELECT, INSERT, CREATE ON *.* 'docker'@'172.17.0.2' IDENTIFIED BY 'XXX';

虽然有点 hack,但我避免了 --net='host' 带来的所有问题

标签: mysqlrdocker

解决方案


是的。您可以将图像作为host模式运行。

docker run --net="host" ...

如果您使用host模式,则意味着您无法在容器中侦听相同的端口,因为这会导致port already bind error.

当您以host模式运行容器时,您可以访问主机的服务器。这是 MySQL,127.0.0.1而不是172.17.0.1.


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