首页 > 解决方案 > 清理fasta文件头

问题描述

我有一个像这样的标题的大型 fasta 文件

>sample_1 M04839:239:000000000-BVKC2:1:1105:7523:23617;size=450

我想要的输出是

>sample_1;size=450

我该怎么做才能改变呢?

标签: awk

解决方案


请您尝试以下操作。

awk -F'[ :;]' '{print $1,$NF}' OFS=";"  Input_file
>sample_1;size=450

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