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python - 检查数据帧元组中的值是否

问题描述

我有一个巨大的数据框（38 milj 行）：

df = pd.DataFrame({'I':[1,2,3,4], 'C':[80,160,240,80],
                   'F':[(1,2,3,4),(5,7,2),(9,6,2,5,7),(4,0,8,3,2)]})

     C                F  I
0   80     (1, 2, 3, 4)  1
1  160        (5, 7, 2)  2
2  240  (9, 6, 2, 5, 7)  3
3   80  (4, 0, 8, 3, 2)  4

现在我想过滤掉包含数字的3行'F'

给予：

     C                F  I
0   80     (1, 2, 3, 4)  1
3   80  (4, 0, 8, 3, 2)  4

有没有一种高性能、低内存使用的方法来做到这一点？

我试过np.equal((3), df['F'].values).all()了，但这显然不起作用

标签： pythonpandasperformancebigdata

解决方案

in与list comprehension如果性能很重要一起使用：

df = df[[3 in x for x in df['F']]]

或者：

df = df[df['F'].apply(set) >= set([3])]

print (df)
   I   C                F
0  1  80     (1, 2, 3, 4)
3  4  80  (4, 0, 8, 3, 2)

性能（取决于匹配值的数量以及 的长度df）：

#[40000 rows x 3 columns]
df = pd.concat([df] * 10000, ignore_index=True)


In [166]: %timeit df[[3 in x for x in df['F']]]
5.57 ms ± 132 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100 loops each)

In [167]: %timeit df[df['F'].apply(lambda x: 3 in x)]
12.2 ms ± 625 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100 loops each)

In [170]:  %timeit df[df['F'].apply(set) >= set([3])]
29 ms ± 396 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10 loops each)

In [171]:  %timeit df[pd.DataFrame(df['F'].values.tolist()).eq(3).any(1)]
37.4 ms ± 248 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10 loops each)

更好的结构，如指向@jpp 是创建：

from itertools import chain

lens = df['F'].str.len()
df = pd.DataFrame({
    'I' : df['I'].values.repeat(lens),
    'C' : df['C'].values.repeat(lens),
    'F' : list(chain.from_iterable(df['F'].tolist()))
})
print (df)
    I    C  F
0   1   80  1
1   1   80  2
2   1   80  3
3   1   80  4
4   2  160  5
5   2  160  7
6   2  160  2
7   3  240  9
8   3  240  6
9   3  240  2
10  3  240  5
11  3  240  7
12  4   80  4
13  4   80  0
14  4   80  8
15  4   80  3
16  4   80  2

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