r - 在 R 中：选择行中数值的数据框函数中的列

Question

请问我可以请教一个建议：

考虑 R 中的数据框，其中包含基因表达的数值：

x <- data.frame(TTT=c(0,1,0,0),
                TTA=c(0,1,1,0),
                ATA=c(1,0,0,0),
                gene=c("gene1", "gene2", "gene3", "gene4"))

我怎样才能只选择基因（行）的值非零的列？

谢谢你！

——波格丹

标签： r

Answer 1

你可以考虑dplyr图书馆。在这个包中，有一个filter函数可以让你根据给定的条件对行进行子集化。

通过_if在函数后面添加，您可以使用轻松选择仅数字列is.numeric。

x <- data.frame(TTT=c(0,1,0,0),
                TTA=c(0,1,1,0),
                ATA=c(1,0,0,0),
                gene=c("gene1", "gene2", "gene3", "gene4"))

library(dplyr)
x %>%
  filter_if(is.numeric, any_vars(. != 0)) # any_vars() takes |

#>   TTT TTA ATA  gene
#> 1   0   0   1 gene1
#> 2   1   1   0 gene2
#> 3   0   1   0 gene3