首页 > 解决方案 > 为多个会话保留 XPtr

问题描述

我有一个 R 函数,它创建一个PrimebaseCpp 类,然后返回一个XPtr<Primebase>指针。

由于构建过程需要大量时间,我想将实例保存Primebase到我的会话中,以便下次打开 RI 时可以直接访问该Primebase实例。

不幸的是,一旦我关闭 R 并XPtr变成null pointer.

有没有办法阻止 R 删除对象或任何其他方法来保存底层对象?

标签: c++rrcpp

解决方案


Rcpp::Xptr当 R 会话结束时,被管理的 C++ 对象被销毁。如果要保存对象,则必须对其进行序列化。Rcereal包装提供了一种不错的可能性。以下示例Primebase在一个构造函数中使用具有人工睡眠的普通类来模拟构造过程中的繁重处理。检查对象的内容后,将其序列化并销毁。之后对象被反序列化并再次包装成一个Xptr。请注意,反序列化比构造便宜得多:

#include <Rcpp.h>
// [[Rcpp::plugins("cpp11")]]
// [[Rcpp::depends(Rcereal)]]
#include <cereal/archives/binary.hpp>
#include <chrono>
#include <fstream>
#include <thread>

class Primebase
{
private:
  int x;

public:
  Primebase() : x{0} {};
  Primebase(int x_) : x{x_} {std::this_thread::sleep_for(std::chrono::seconds(1));};

  int answer() {return x;}

  template <class Archive>
  void serialize(Archive & ar)
  {
    ar(x);
  }
};

// [[Rcpp::export]]
Rcpp::XPtr<Primebase> create(int x) {
  Primebase* instance = new Primebase(x);
  return Rcpp::XPtr<Primebase>(instance);
}


// [[Rcpp::export]]
int answer(Rcpp::XPtr<Primebase> xptr) {
  return xptr.get()->answer();
}

// [[Rcpp::export]]
void mySerialize(Rcpp::XPtr<Primebase> xptr, std::string filename) {
  std::ofstream os(filename, std::ios::binary);
  cereal::BinaryOutputArchive archive(os);
  archive(*xptr.get());
}

// [[Rcpp::export]]
Rcpp::XPtr<Primebase> myDeserialize(std::string filename) {
  std::ifstream is(filename, std::ios::binary);
  cereal::BinaryInputArchive archive(is);
  Primebase* instance = new Primebase;
  archive(*instance);
  return Rcpp::XPtr<Primebase>(instance);
}


/*** R
system.time(xptr <- create(42))
answer(xptr)
mySerialize(xptr, "test.cereal")
rm(xptr)
exists("xptr")
system.time(xptr <-myDeserialize("test.cereal")) 
answer(xptr)
*/

输出:

> system.time(xptr <- create(42))
   user  system elapsed 
  0.000   0.000   1.001 

> answer(xptr)
[1] 42

> mySerialize(xptr, "test.cereal")

> rm(xptr)

> exists("xptr")
[1] FALSE

> system.time(xptr <-myDeserialize("test.cereal")) 
   user  system elapsed 
      0       0       0 

> answer(xptr)
[1] 42

参考:


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