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python - 具有紧密轴和匹配纵横比的散景图像图

问题描述

我在 Django 应用程序中使用散景 1.0.1 版本，我想将微观表面图像显示为具有颜色编码高度和颜色条的可缩放图像图。原则上这是可行的，但我无法获得具有正确纵横比的图，仅显示没有空间的图像。

这是我想要实现的示例：结果图应该

对于图像，我只使用nx=100x 方向上的ny=100点和 y 方向上的点的随机数据。

这是我的第一种方法：

尝试 1

from bokeh.models.ranges import Range1d
from bokeh.plotting import figure, show
from bokeh.models import LinearColorMapper, ColorBar
import numpy as np

sx = 10
sy = 5

nx = 100
ny = 100    
arr = np.random.rand(nx, ny)

x_range = Range1d(start=0, end=sx, bounds=(0,sx))
y_range = Range1d(start=0, end=sy, bounds=(0,sy))

# Attempt 1
plot = figure(x_range=x_range, y_range=y_range, match_aspect=True)

# Attempt 2
# plot = figure(match_aspect=True)

# Attempt 3
# pw = 400
# ph = int(400/sx*sy)
# plot = figure(plot_width=pw, plot_height=ph, 
#               x_range=x_range, y_range=y_range, match_aspect=True)

color_mapper = LinearColorMapper(palette="Viridis256", 
                                 low=arr.min(), high=arr.max())
colorbar = ColorBar(color_mapper=color_mapper, location=(0,0))

plot.image([arr], x=[0], y=[0], dw=[sx], dh=[sy],  
           color_mapper=color_mapper)
plot.rect(x=[0,sx,sx,0,sx/2], y=[0,0,sy,sy,sy/2], 
          height=1, width=1, color='blue')

plot.add_layout(colorbar, 'right')    
show(plot)

我还在绘图中添加了蓝色方块，以便查看纵横比要求何时失败。

不幸的是，在生成的图片中，正方形不再是正方形，它是宽的两倍。缩放和平移按预期工作。

尝试 2

当通过使用遗漏范围时

plot = figure(match_aspect=True)

我会得到这张照片的。正方形是屏幕上的正方形，这很好，但是轴范围改变了，所以现在它周围有空间。我只想让图像覆盖的数据区域。

尝试 3

或者，当为图形提供 aplot_height和时plot_width，具有预定义的纵横比，例如通过

pw = 800 # plot width
ph = int(pw/sx*sy)
plot = figure(plot_width=pw, plot_height=ph, 
              x_range=x_range, y_range=y_range, 
              match_aspect=True)

我会得到这张照片的。广场也不再是广场了。它几乎可以做到，但很难，因为 plot_width 还包括颜色栏和工具栏。

我已经阅读了这篇相应的博客文章 和相应的散景文档，但我无法让它工作。

有谁知道如何实现我想要的或者它是否不可能？响应式行为也很好，但我们现在可以忽略它。感谢您的任何提示。

更新

在与Gitter上的 Bokeh 开发人员交谈后（感谢 Bryan！），我想要的似乎几乎是不可能的。

原因是，如何match_aspect=True使数据空间中的正方形看起来像像素空间中的正方形：给定画布大小，这可能是由于sizing_mode对响应行为应用不同设置而产生的，然后更改数据范围以使匹配纵横比。因此，没有其他方法可以使像素纵横比与数据纵横比相匹配，而无需在图像周围添加额外空间，即在给定范围内扩展轴。另请参阅此问题的评论。

没有响应行为，然后根据纵横比预先固定画布大小是可以做到的，但目前并不完美，因为内部图框周围的所有其他元素也占用空间。有一个PR可以直接控制内部框架尺寸，但我不知道该怎么做。

好吧，如果我放弃拥有紧轴的目标怎么办？这是在上面的“尝试 2”中完成的，但是图像周围有太多空白空间，与图像绘图占用的空间相同。

我尝试使用各种range_padding*属性，例如

x_range = DataRange1d(range_padding=10, range_padding_units='percent')
y_range = DataRange1d(range_padding=10, range_padding_units='percent')

但它不会减少情节周围的空间量，而只会增加它。以百分比表示的填充应该与dh和给出的图像尺寸相关dw。

有谁知道如何使用range_padding参数来获得更小的轴范围或另一种方式在上面的示例中的图像图周围有更小的填充（使用match_aspect=True）？我对此提出了另一个问题。

标签： pythonplotbokehaspect-ratio

解决方案

你能接受这个解决方案（适用于 Bokeh v1.0.4）吗？

from bokeh.models.ranges import Range1d
from bokeh.plotting import figure, show
from bokeh.layouts import Row
from bokeh.models import LinearColorMapper, ColorBar
import numpy as np

sx = 10
sy = 5

nx = 100
ny = 100
arr = np.random.rand(nx, ny)

x_range = Range1d(start = 0, end = sx, bounds = (0, sx))
y_range = Range1d(start = 0, end = sy, bounds = (0, sy))

pw = 400
ph = pw * sy / sx
plot = figure(plot_width = pw, plot_height = ph,
              x_range = x_range, y_range = y_range, match_aspect = True)

color_mapper = LinearColorMapper(palette = "Viridis256",
                                 low = arr.min(), high = arr.max())

plot.image([arr], x = [0], y = [0], dw = [sx], dh = [sy], color_mapper = color_mapper)
plot.rect(x = [0, sx, sx, 0, sx / 2], y = [0, 0, sy, sy, sy / 2], height = 1, width = 1, color = 'blue')

colorbar_plot = figure(plot_height = ph, plot_width = 69, x_axis_location = None, y_axis_location = None, title = None, tools = '', toolbar_location = None)
colorbar = ColorBar(color_mapper = color_mapper, location = (0, 0))
colorbar_plot.add_layout(colorbar, 'left')

show(Row(plot, colorbar_plot))

结果：

在此处输入图像描述

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