首页 > 解决方案 > Seaborn 热图,单元格之间没有线条

问题描述

我正在尝试使用带有透明颜色图的 seaborn 创建热图,因为应该在背景中显示图像。到目前为止,热图创建工作正常,但是即使热图的线宽设置为 0.0,单元格之间的某些线条仍然可见。

创建热图的代码如下所示:

ax = sns.heatmap(image, cmap="rocket_r", linewidths=0.0)
ax.collections[0].set_alpha(0.5)

image64x64 numpy 数组在哪里。生成的热图如下所示: 图(抱歉,嵌入图片的声誉不足)

问题是细胞之间的细线。奇怪的是,他们并不是在每一个边缘。

任何人都知道如何摆脱这些线?

非常感谢


更新 1(完整的工作示例):

image = np.array([[1, 1, 2, 2], [3, 3, 3, 3], [4, 5, 4, 5], [6, 6, 6, 6]])
ax = sns.heatmap(image, cmap="rocket_r", linewidths=0.0)
ax.collections[0].set_alpha(0.5)
plt.show()

结果是这个热图:

这张热图

在这里,您可以看到每列之间有细线,但第一行和第二行之间没有任何线。

标签: pythonseabornheatmap

解决方案


这些线是半透明补丁的重叠,无法在像素网格上完美对齐。

阿尔法混合

一种选择是不使用透明度,而是使用 alpha 混合创建不透明的颜色。

import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib.colors import ListedColormap
import numpy as np
import seaborn as sns

def get_alpha_blend_cmap(cmap, alpha):
    cls = plt.get_cmap(cmap)(np.linspace(0,1,256))
    cls = (1-alpha) + alpha*cls
    return ListedColormap(cls)

image = np.array([[1, 1, 2, 2], [3, 3, 3, 3], [4, 5, 4, 5], [6, 6, 6, 6]])
ax = sns.heatmap(image, cmap=get_alpha_blend_cmap("rocket_r", 0.5), linewidths=0.0)

plt.show()

在此处输入图像描述

这样做的一个明显优势是颜色条与热图具有相同的颜色。

增加 dpi

如果以上不是一个选项,您可以在保存时增加 dpi。

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
import seaborn as sns

image = np.array([[1, 1, 2, 2], [3, 3, 3, 3], [4, 5, 4, 5], [6, 6, 6, 6]])
ax = sns.heatmap(image, cmap="rocket_r", linewidths=0.0, edgecolor="none", alpha=0.5)
plt.savefig("test.png", dpi=1000)

在此处输入图像描述

当然,这对屏幕上显示的图形没有任何影响。

显示

最后,考虑不要在这里使用 seaborn,而是使用 matplotlibimshow图。

import matplotlib.pyplot as plt
import seaborn as sns
plt.style.use("seaborn-dark")
plt.rcParams["axes.facecolor"] = "white"
import numpy as np

image = np.array([[1, 1, 2, 2], [3, 3, 3, 3], [4, 5, 4, 5], [6, 6, 6, 6]])
im = plt.imshow(image, cmap="rocket_r", alpha=0.5)
plt.colorbar(im)
plt.gca().set(xticks=(range(image.shape[1])),yticks=(range(image.shape[0])))
plt.show()

在此处输入图像描述


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