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networkx - 使用 Holoviews 的 from_networkx 方法时如何将节点属性传递给 HoverTool 工具提示

问题描述

全息视图、散景和networkx的新手。

我正在尝试构建一个可视化，在其中显示悬停时的所有节点属性。我正在使用 networkx 构建图形，并使用 Holoviews 的 from_networkx 方法导入到 holoviews 图形类。

我已经看到这是相关的（即使用 from_networkx 时现在导入节点属性）： https ://github.com/ioam/holoviews/issues/2696

但是，我很难在工具提示中引用节点属性。这是使用空手道俱乐部示例的代码，它有效：

%%opts Graph [color_index='circle']
%%opts Graph (node_size=5 edge_line_width=1)
%opts Graph [width=900 height=900]

colours = ['#000000']+hv.Cycle('Category20').values

G_kcg = nx.karate_club_graph()

hover_kcg = HoverTool(tooltips=[("Club", "@club")])

plot_kcg = hv.Graph.from_networkx(G_kcg, nx.spring_layout)
plot_kcg = plot_kcg.options(cmap=colours,tools=[hover_kcg])

bundled = bundle_graph(plot_kcg)
bundled

但是，切换到我自己的数据集，它只返回 '???' 在工具提示中：

%%opts Graph [color_index='circle']
%%opts Graph (node_size=5 edge_line_width=1)
%opts Graph [width=900 height=900]

colours = ['#000000']+hv.Cycle('Category20').values

hover = HoverTool(tooltips=[("Name", "@crew_name")])

plot_all = hv.Graph.from_networkx(G_all, nx.spring_layout)
plot_all = plot_all.options(cmap=colours,tools=[hover])

bundled = bundle_graph(plot_all)
bundled

两个图的 NodeDataView 输出在我看来是相同的格式：

G_kcg.nodes(data=True)

俱乐部”：“先生。嗨'}，22：{'club'：'Officer'}，23：{'club'：'Officer'}，24：{'club'：'Officer'}，25：{'club'：'Officer' }，26：{'club'：'Officer'}，27：{'club'：'Officer'}，28：{'club'：'Officer'}，29：{'club'：'Officer'}， 30：{'club'：'Officer'}，31：{'club'：'Officer'}，32：{'club'：'Officer'}，33：{'club'：'Officer'}}）

G_all.nodes(data=True)

NodeDataView({12240216: {'crew_name': u'a'}, ... 8421367: {'crew_name': u'b'}})

抱歉，如果我根本没有把问题说清楚，我会很感激我能得到的任何帮助，因为我已经连续几个小时在这个问题上猛烈抨击了！

谢谢 ：）

标签： networkxbokehholoviews

解决方案

尝试：无法在散景网络图中填充悬停工具提示值

您可以尝试将inspection_policy 设置为“nodes”

或者，您可以将其添加到/从属性到边缘，然后使用inspection_policy 'edges'

这是使用边缘方法的基本示例

G = nx.karate_club_graph()

nx.set_edge_attributes(G,'','from')
nx.set_edge_attributes(G,'','to')
for edge in G.edges:
    G.edges.get(edge)['from']=G.nodes.get(edge[0])['club']
    G.edges.get(edge)['to']=G.nodes.get(edge[1])['club']

hover_kcg = HoverTool(tooltips=[("From", "@from"),("To","@to")])

hv.Graph.from_networkx(G, nx.spring_layout).opts(
    tools=[hover_kcg],
    inspection_policy='edges'    #this is where you'll want to double check
)

-或者-

hover_kcg = HoverTool(tooltips=[("Club", "@club")])
hv.Graph.from_networkx(G, nx.spring_layout).opts(
    tools=[hover_kcg],
    inspection_policy='nodes'    
)

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