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python - 如何在 colab.research 上安装 rpy2？

问题描述

如何在 colab.research.google 上安装 rpy2？我尝试了命令：

pip install rpy2 
import rpy2

但它不起作用。这是得到的错误：

Collecting rpy2
Using cached https://files.pythonhosted.org/packages/02/d1/074ffbbe7b4bf74c60b75d74c8e67a1e4515b0d85f85cd6540e39610754a/rpy2-2.9.5.tar.gz
Complete output from command python setup.py egg_info:
Error: Tried to guess R's HOME but no command 'R' in the PATH.

----------------------------------------
Command "python setup.py egg_info" failed with error code 1 in /tmp/pip-install-je87ula0/rpy2/

---------------------------------------------------------------------------

ModuleNotFoundError                       Traceback (most recent call last)

<ipython-input-15-93ecdf466471> in <module>()
  1 get_ipython().system('pip install rpy2')
----> 2 import rpy2

ModuleNotFoundError: No module named 'rpy2'

提前感谢您的帮助，伊内斯。

标签： pythonr

解决方案

写!pip install rpy2而不是pip install rpy2

编辑

根据可以在此处找到的 rpy2 的文档：

运行 Rpy2 需要为 R、Python 和 readline 编译的库；构建 rpy2 将需要相应的开发标头（有关构建 rpy2 的更多信息，请查看文档）。

所以，这应该工作

!apt-get install r-base
!pip install rpy2

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