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postgresql - PostgreSQL 查询 - 类型转换

问题描述

执行 PostgreSQL 查询

从两个列表中搜索数据库中的匹配项时，我收到以下错误：

    ProgrammingError: operator does not exist: character varying ~~ text[]
LINE 1: ...FROM public."Phosphosite_table" WHERE "GENE_NAME" LIKE ARRAY...
                                                             ^
HINT:  No operator matches the given name and argument type(s). You might need to add explicit type casts.

我的代码如下：

start = time.time()

input_file = "az20.tsv"

names = []
residuelist = []
kinase = []
fclist = []

with open(input_file, "r") as data:
    data = csv.reader(data, delimiter='\t')
    next(data, None)
    for row in data:
        data = row[0:6]
        if "(" in data[0]:
            name = data[0].split("(")[0]
            residue1 = data[0].split("(")[1]
            residue = residue1.split(")")[0]
            fc = data[3]
        else:
            pass
        if "_" in name: 
            name = name.split("_")[0]  
        if residue != "None":
            names.append(str(name))
            residuelist.append(str(residue))
            fclist.append(fc)

genename = names
location = residuelist

connection = pg.connect(HAHAHA)

cur = connection.cursor()

cur.execute('SELECT "KINASE_NAME" FROM public."Phosphosite_table" WHERE "GENE_NAME" LIKE %s and "RESIDUE" LIKE %s',\
            (genename, location))

query = cur.fetchall()

print query

connection.close()

end = time.time()
print str((end - start)/60) + " Minutes"

我做了一些研究，似乎 PostgreSQL 不执行任何类型转换。但是，我认为这将是一个字符串与一个字符串的比较，我在添加到我的列表之前对其进行了更改。有人有建议吗？

康纳

标签： postgresql

解决方案

但是，我认为这将是一个字符串与一个字符串的比较

错误消息的一部分character varying ~~ text[]告诉您，您正在将字符串（“字符变”）与数组（“文本 []”）进行比较。

如果要将单个值与数组的所有元素进行比较，则需要使用ANY运算符：

WHERE "GENE_NAME" LIKE any(%s)

假设%s从您的代码中作为本机 Postgres 数组传递（这似乎是给定错误消息的情况）。

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