r - UpSetR 中的堆积条形图

Question

我一直在寻找一种在uptR图中显示堆积条形图的方法。我下载了电影数据集（从这里）并添加了一个只有两个值“M”和“C”的列。下面，有关我如何加载数据并添加“x”列的信息。

编辑：

m <- read.csv(system.file("extdata", "movies.csv", package = "UpSetR"), 
                           header = T, sep = ";")
nrow(m)
[1] 3883
x<-c(rep("M", 3000), rep("C", 883))
m<-cbind(m, x)  
unique(m$x)
[1] M C

这是数据框的结构：

str(m)
'data.frame':   3883 obs. of  22 variables:
 $ Name       : Factor w/ 3883 levels "$1,000,000 Duck (1971)",..: 3577 1858 1483 3718 1175 1559 3010 3548 3363 1420 ...
 $ ReleaseDate: int  1995 1995 1995 1995 1995 1995 1995 1995 1995 1995 ...
 $ Action     : int  0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 ...
 $ Adventure  : int  0 1 0 0 0 0 0 1 0 1 ...
 $ Children   : int  1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 ...
 $ Comedy     : int  1 0 1 1 1 0 1 0 0 0 ...
 $ Crime      : int  0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 ...
 $ Documentary: int  0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
 $ Drama      : int  0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 ...
 $ Fantasy    : int  0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
 $ Noir       : int  0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
 $ Horror     : int  0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
 $ Musical    : int  0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
 $ Mystery    : int  0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
 $ Romance    : int  0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 ...
 $ SciFi      : int  0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
 $ Thriller   : int  0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 ...
 $ War        : int  0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
 $ Western    : int  0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
 $ AvgRating  : num  4.15 3.2 3.02 2.73 3.01 3.88 3.41 3.01 2.66 3.54 ...
 $ Watches    : int  2077 701 478 170 296 940 458 68 102 888 ...
 $ x          : Factor w/ 2 levels "M","C": 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...

现在我尝试实现堆积条形图，如下所示：

upset(m,
  queries = list(
    list(query = elements, 
         params = list("x", "M"), color = "#e69f00", active = T),
    list(query = elements, 
         params = list("x", "C"), color = "#cc79a7", active = T)))

结果如下所示：

如您所见，比例是错误的，因为每个条中应该只有两种颜色（因子）“M”或“C”。正如这里也指出的那样，这个问题似乎不是一个小问题。有人知道如何在 UpsetR 中实现这一点吗？非常感谢

标签： rdataframedata-visualizationdataviewupsetr

Answer 1

这是一种使用堆叠条形图创建不安图的方法，但使用我的 ComplexUpset 而不是 UpSetR：

library(ComplexUpset)
movies = as.data.frame(ggplot2movies::movies)
genres = colnames(movies)[18:24]

# for simplicity of examples, only use the complete data points
movies[movies$mpaa == '', 'mpaa'] = NA
movies = na.omit(movies)


upset(
    movies,
    genres,
    base_annotations=list(
        'Intersection size'=intersection_size(
            counts=FALSE,
            mapping=aes(fill=mpaa)
        )
    ),
    width_ratio=0.1
)

请参阅文档中的更多示例。GitHub 上提供了安装说明：krassowski/complex-upset（还有与 UpSetR 和其他软件包的比较）。