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r - 'Calloc' 无法使用 kernelUD 函数分配内存

问题描述

我知道，不久前有人问过类似的问题（“'Calloc'could not allocate memory” in 64-bit R），我试图在那里问，但我被删除了......虽然正如我在我的问题中所说，我确实尝试了他们的解决方案（更新插件），但它对我不起作用。Sooo，让我再试一次：）

当我尝试使用包中的kernelUD()函数时adehabitatHR，根据h参数值，我得到了那个错误。它使用h="href"参数，但不使用h="LSCV"（不同的平滑参数）

require(adehabitatHR)
BCLoc <- puechabonsp$relocs[, 1] #data comes with adehabitatHR
BC.href <- kernelUD(BCLoc, h="href") #works :)
BC.LSCV <- kernelUD(BCLoc, h="LSCV") #gets error :(

Error in .kernelUDs(SpatialPoints(x, proj4string = CRS(as.character(pfs1))),  : 
  'Calloc' could not allocate memory (18446744071710095360 of 8 bytes)

有任何想法吗？

标签： r

解决方案

我有完全相同的问题。据我所知，如果迁移次数过多，LSCV 似乎表现不佳（或干脆惨败）（Hemson 等人 2005 Journal of Animal Ecology 2005. 74, 455–463）。我的很大，当我尝试使用 hLSCV 运行 KDE 时，R 会话在开始时中止，尽管所有这些都与 ref 运行良好。

当我减少样本时，我得到了您询问的错误。进一步减少它，我开始得到一个新的错误：

In .kernelUDs(SpatialPoints(x, proj4string = CRS(as.character(pfs1))),  :
  The algorithm did not converge within the specified range of hlim:
  try to increase it

不管我把他设得多高，它都没有收敛。一个可能的解决方案是使用“抖动”功能向重定位添加噪音，如下所述：https ://ecosystems.psu.edu/research/labs/walter-lab/manual/home-range-estimation/link-to -pdf和这里https://animov.faunalia.narkive.com/NnG9nLKl/again-kernelud-and-lscv

不过，它对我不起作用，但我希望这对任何人都有帮助

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