r - Rtsne 函数仅读取我的数据集的一部分

Question

我对处理高维数据完全陌生。我目前正在尝试在我的数据集上在 R 中执行 t-SNE。当我运行我的代码（请参见下文）时，Rtsne 函数仅读取 30x30 矩阵。我的数据集是 30x72 矩阵，有 30 个观察值（行）和 72 个变量（列）。

proclus.tSNE<-Rtsne(mydataset, dims = 2, perplexity=9, verbose=TRUE, max_iter = 5000)

我不确定为什么我的矩阵的其余部分没有被读取。任何帮助将不胜感激。

mydataset是蛋白质表达值的矩阵。

谢谢！

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