python-3.x - 如何影响图形节点的位置以进行可视化？

Question

我有一个Networkx从 a读取的图表，Dotfile为了可视化它，我需要影响每个节点的位置 (x,y)。我怎样才能做到这一点 ？

为了可视化，我Plotly在 python3.6 上使用离线模式，为此我需要边缘和节点的位置。现在，我尝试给出随机值，但这似乎根本不起作用

基本上，我用于绘图的代码是这个：https : //plot.ly/python/network-graphs/ 该算法使用随机创建的 Graph 中的“pos”，但对我来说，我没有这些坐标和我不知道如何生成它们。

标签： python-3.xgraphdata-visualizationnetworkx

Answer 1

您要解决的问题称为图形布局。networkx 中有一些图形布局算法：networkx.drawing.layout。这是示例：

import networkx as nx

G = nx.Graph()
G.add_nodes_from([1,2,3,4,5])
G.add_edges_from([(1,2),(2,3),(2,4),(4,5)])
nx.spring_layout(G)

返回所有节点的坐标：

{1: array([-0.73835686,  0.38769421]),
 2: array([-0.11386106,  0.22912486]),
 3: array([0.14264776, 0.81717097]),
 4: array([ 0.21475452, -0.43399004]),
 5: array([ 0.49481564, -1.        ])}