首页 > 解决方案 > 将qiime指向包含R相关程序的路径

问题描述

我已经从 .tar.gz 包中安装了一个程序(biom,因为即使它已经过时,我也需要它来编写 qiime 脚本)。问题是当我运行 qiime 脚本时,R 正在寻找不同的来源

(/home/username/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4, /home/username/anaconda2/lib/R/library)

比我安装的 R 实例(3.30),它正在查看

("/home/username/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.3" "/usr/local/lib/R/site-library" "/usr/lib/R/site-library" "/usr /lib/R/库")

Biom安装在/home/username/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.3,所以qiime R-instance看不到。我怎样才能让qiime的R看到biom?

我尝试将我的 R 实例从不支持 biom 的 3.5 降级到支持 biom 的 3.3。

标签: rlinuxqiime

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