r - 高亮基因与 colnames 共同

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我有一个空矩阵，其中基因在列中，样本在行中，例如

> head(empty_matrix[,1:4])
      TP53 CDKN2A KRAS MYC
t_005   NA     NA   NA  NA
o_005   NA     NA   NA  NA
t_013   NA     NA   NA  NA
o_013   NA     NA   NA  NA
o_021   NA     NA   NA  NA
o_036   NA     NA   NA  NA
>

对于每个样本，我都有一个基因列表；例如，对于样本 t_005，我有这些基因，我想突出显示哪些基因存在于我的空矩阵的列名中

LRRK2
NAV3
PCDH17
AXIN1
ZFHX3
TP53
SMAD4
CCDC102B
STK11
SCN3A
CHL1
CTNNB1
EPHA3
SLIT2
FBXW7
ARID1B
EGFR
ABCB1
CDK6
BRAF
KCNQ3

如果我的矩阵的列名中存在一个基因，我想写MUT；为了那个原因; 例如样本t_005如果我有基因 TP53我想写MUT；在列中对应于基因 TP53 和样本t_005因为TP53存在于我的矩阵的 colnames 我不知道该怎么做

标签： rloopsintersection

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