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python - 从 Python 脚本运行 ImageJ 宏未找到错误

问题描述

标签： pythonsubprocessimagej

解决方案

打开一个 shellsubprocess不会让它执行.bashrc，因此它永远不会看到$PATH. 您可以尝试将shell=False参数添加到Popen()调用中。其他选项包括PATH以另一种方式将 imagej 添加到您的文件中，或者使用程序本身的完整路径调用 imagej，根本不需要$PATH变量。

例如：

cmd = ["/usr/lib/jvm/java-11-openjdk-amd64/bin/java/imagej", "-macro", "luerlocktest.ijm"]

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