r - 在基础 R 中翻转热图的颜色范围

Question

我正在基础 R 中构建一个简单的热图。这是我的矩阵：

stleft = matrix( 
     c(0,5,5,2,6,8,4,6,9), 
     nrow=3, 
     ncol=3) 
colnames(stleft) <- c("Narrow","Wide", "Wider")
rownames(stleft) <- c("Person", "Object","Bare")
stleft

矩阵如下所示：

> stleft
       Narrow Wide Wider
Person      0    2     4
Object      5    6     6
Bare        5    8     9

要构建热图，我只需运行：

heatmap(stleft, Colv = NA, Rowv = NA, scale = "none")

如您所见，“0”（对应于窄/人单元格）显示为深红色，而“9”（对应于较宽/裸单元格）显示为浅黄色。

• 我怎样才能“翻转”这个范围，使“0”出现在浅色中，“9”出现在深色中？

• 为什么图像被截断？它在 RStudio 绘图面板中显示为被截断，并被截断保存。我试图放大 R Studio 中的绘图面板无济于事。

标签： rcolorsheatmap

Answer 1

heatmap()(and image()) 用于heat.colors()默认生成颜色。如果需要，您可以提供自己的颜色，f.ex。通过使用heat.colors(), 刚好相反。

par(oma=c(3, 0, 0, 3))
col <- rev(heat.colors(999))
heatmap(stleft, Colv = NA, Rowv = NA, scale = "none", col = col)