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r - randomForest 模型大小取决于训练集大小：避免的方法？

问题描述

我正在训练一个 randomForest 模型，目的是保存它以进行预测（它将被下载并在外部环境中使用）。我希望这个模型尽可能小。

我读过有许多选项和包可以减少模型的内存大小。

不过，我不明白为什么训练集的大小与模型的大小有关？毕竟，一旦有了森林的系数，为什么还需要保留原始数据集呢？

df <- iris
model <- randomForest::randomForest(Species ~ ., data = df, 
                 localImp = FALSE,
                 importance = FALSE,
                 keep.forest = TRUE,
                 keep.inbag = FALSE,
                 proximity=FALSE,
                 ntree = 25)
object.size(model)/1000
#> 73.2 bytes

df <- df[sample(nrow(df), 50), ]
model <- randomForest::randomForest(Species ~ ., data = df, 
                 localImp = FALSE,
                 importance = FALSE,
                 keep.forest = TRUE,
                 keep.inbag = FALSE,
                 proximity=FALSE,
                 ntree = 25)
object.size(model)/1000
#> 43 bytes

由reprex 包（v0.2.1）于 2019 年 5 月 21 日创建

我已经尝试过上面提到的技巧来减小大小，但与训练集大小的作用相比，它们的效果是微不足道的。有没有办法删除这些信息？

标签： rmachine-learningmemory-managementclassificationrandom-forest

解决方案

我认为您可以在适合后删除模型的某些部分：

object.size(model)/1000
# 70.4 bytes

model$predicted <- NULL # remove predicted
model$y <- NULL # remove y
#.. possibly other parts aren't needed
object.size(model)/1000
# 48.3 bytes

我检查了predict(model, df)它是否仍然有效，并且确实有效。

用来names(model)检查里面的元素model。

看起来$votes很大，你不需要它，这里有更多我安全删除的项目：

model$predicted <- NULL
model$y <- NULL
model$err.rate <- NULL
model$test <- NULL
model$proximity <- NULL
model$confusion <- NULL
model$localImportance <- NULL
model$importanceSD <- NULL
model$inbag <- NULL
model$votes <- NULL
model$oob.times <- NULL


object.size(model)/1000
# 32.3 bytes

例子：

df <- iris
model <- randomForest::randomForest(Species ~ ., data = df, 
                 localImp = FALSE,
                 importance = FALSE,
                 keep.forest = TRUE,
                 keep.inbag = FALSE,
                 proximity=FALSE,
                 ntree = 25)

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