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r - 当向量的长度发生变化时如何遍历向量？

问题描述

我最初有两个相同长度的向量。这第一个充满了蛋白质修饰位点即“E123”。第二个是本站文献引用的唯一代码。我需要通过这些向量从同一篇论文中删除对同一站点的多个引用。也就是说，如果 VectorOne[1] == VectorOne[2] && VectorTwo[1] == VectorTwo[2]，我需要删除重复项。问题是当我使用 for 循环遍历数据时，我可能会更改向量的长度，这意味着我使用的索引可能不再正确。

一旦我从向量中删除了一个元素，我循环到 length(primarySite) 的值就太高了，代码就会崩溃。

以下是这两个向量的前 10 个值的示例：

primarySite[1:10]
 [1] ""     ""     "D248" "E241" "E242" "E241" "E242" "D244" "D244" "E241"
sitePMID[1:10]
 [1] 24641686 24055347 23955771 23955771 23955771 23955771 23955771 23955771 23955771 23955771

Desired Output:
primarySite[1:6]
 [1] ""     ""     "D248" "E241" "E242" "D244" 
sitePMID[1:6]
 [1] 24641686 24055347 23955771 23955771 23955771 23955771 


for(i in 1:length(primarySite)){
      for(j in (i+1):length(primarySite)){
        if(primarySite[i] == primarySite[j] && sitePMID[i] ==      
sitePMID[j]){
      primarySite <- primarySite[-j]
      sitePMID <- sitePMID[-j]

    } 
  }
}

标签： r

解决方案

如果我们将向量放入数据框中，这很容易：

data = data.frame(primarySite, sitePMID)
deduplicated_data = unique(data)

您可以在 R-FAQ 中找到许多其他方法

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