r - 如何解决 R 包安装的内存问题
问题描述
我在尝试通过添加其他数据来升级我的数据包时遇到错误。问题是我遇到了内存错误。我相信其他人已经制作了包含更大数据集的包。人们如何解决这个问题?
==> R CMD INSTALL --no-multiarch --with-keep.source cfsales
* installing to library ‘/usr/local/lib/R/site-library’
* installing *source* package ‘cfsales’ ...
** using staged installation
** R
** data
*** moving datasets to lazyload DB
Error in lazyLoadDBinsertVariable(vars[i], from, datafile, ascii, compress, :
long vectors not supported yet: connections.c:5984
ERROR: lazydata failed for package ‘cfsales’
* removing ‘/usr/local/lib/R/site-library/cfsales’
Warning in q("no", status = status, runLast = FALSE) :
system call failed: Cannot allocate memory
这是我的数据目录中的内容以及以 MB 为单位的文件大小的列表。
total 188M
-rw-rw-r-- 1 ahallam ahallam 1M Jun 17 20:18 holidays_events.rda
-rw-rw-r-- 1 ahallam ahallam 1M Jun 17 20:18 items.rda
-rw-rw-r-- 1 ahallam ahallam 1M Jun 17 20:18 oil.rda
-rw-rw-r-- 1 ahallam ahallam 1M Jun 20 08:51 store_day_sales.rda
-rw-rw-r-- 1 ahallam ahallam 1M Jun 17 20:18 stores.rda
-rw-rw-r-- 1 ahallam ahallam 2M Jun 19 17:23 test.rda
-rw-rw-r-- 1 ahallam ahallam 185M Jun 19 17:36 train.rda
-rw-rw-r-- 1 ahallam ahallam 1M Jun 17 20:18 transactions.rda
这是我的sessionInfo
> sessionInfo()
R version 3.6.0 (2019-04-26)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Ubuntu 18.04.2 LTS
Matrix products: default
BLAS: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/openblas/libblas.so.3
LAPACK: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopenblasp-r0.2.20.so
locale:
[1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8 LC_NUMERIC=C LC_TIME=en_US.UTF-8 LC_COLLATE=en_US.UTF-8 LC_MONETARY=en_US.UTF-8
[6] LC_MESSAGES=en_US.UTF-8 LC_PAPER=en_US.UTF-8 LC_NAME=C LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
other attached packages:
[1] cfsales_0.0.0.9000
loaded via a namespace (and not attached):
[1] Rcpp_1.0.1 clisymbols_1.2.0 packrat_0.5.0 crayon_1.3.4 withr_2.1.2 rprojroot_1.3-2 assertthat_0.2.1 R6_2.4.0
[9] backports_1.1.4 git2r_0.25.2 magrittr_1.5 rlang_0.3.4 rstudioapi_0.10 fs_1.3.1 testthat_2.1.1 desc_1.2.0
[17] tools_3.6.0 glue_1.3.1 pkgload_1.0.2 compiler_3.6.0 usethis_1.5.0
解决方案
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