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c++ - 如何使用 Makevars 链接到 RCPP 中已编译的外部共享库？

问题描述

我查看了多个地方，但没有找到一个简单的例子来解决我的问题。

我需要的是能够使用我拥有的多个 .so 文件（连同 .h 文件）。

一个简单的例子是：

我有以下文件：啊，a.cp​​p 函数 jeden - 这是我的 R 库 accessor.cpp，它向 R 公开来自外部库 libdwa.so 的函数 dwa。我有头文件 dwa.h 和这个库 libdwa.so。

只有当我将库文件 libdwa.so 放入目录'/usr/lib'（我使用 Debian）时，我才能管理构建二进制包（一切正常）。但这不是可分割的解决方案。

我应该在哪里放置库“dwa”文件（dwa.h 和 libdwa.so）以及在 Makevars 文件中添加哪些标志以获得可移植解决方案？

已添加摘要

我在这里总结了我的结果。我相信一些极其简单的例子在开始时很有用。

  1. 2个外部库放入inst：

    /inst/include/dwa.h
/inst/include/trzy.h
/inst/jeden/libdwa.so
/inst/jeden/libtrzy.so

  2. 配置文件/configure具有以下形式（test6 是包的名称）：

    #!/bin/bash
rpath=$(${R_HOME}/bin/Rscript -e 'cat(file.path(.libPaths()[1], "test6", "jeden"))') #'
sed -e"s|@rpath@|"${rpath}"|" src/Makevars.in > src/Makevars

exit 0

  3. 文件/src/Makevars.in具有以下形式：

    CXX_STD = CXX11

PKG_CPPFLAGS = -I../inst/include/ -I.
PKG_LIBS     = -ldwa -ltrzy -L../inst/jeden -Wl,-rpath,@rpath@

  4. /src/accessor.cpp将库函数暴露给 R ：

    #include <Rcpp.h>
#include "../inst/include/dwa.h"
#include "../inst/include/trzy.h"

// [[Rcpp::export]]
Rcpp::String r_dwa() {
  Rcpp::String res = dwa();.
  return res;
}

// [[Rcpp::export]]
Rcpp::String r_trzy() {
  Rcpp::String res = trzy();.
  return res;
}

  5. 纯 R 库 _/src/hello_world.cpp_ 也存在：

    #include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp;

// [[Rcpp::export]]
String hello_world() {
  String hw = "Hello World";
  return hw ;
}

  6. 最后/NAMESPACE文件：

    useDynLib("test6", .registration=TRUE)

import("Rcpp")
importFrom("utils", "object.size", "packageVersion")
exportPattern("^[[:alpha:]]+")

构建源代码包和二进制包是成功的，但只有源代码包是有用的，因为二进制文件具有严格编写的库的路径。

标签： c++rcpp

解决方案

假设您有一个目录结构，例如

/opt/dwa/include/dwa.h
/opt/dwa/lib/libdwa.so

在这种情况下，您可以使用 is src/Makevars：

PKG_CPPFLAGS = -I/opt/dwa/include
PKG_LIBS = -L/opt/dwa/lib -ldwa -Wl,-rpath,/opt/dwa/lib

当然，这仍然是不可移植的，因为库和头文件的路径是硬编码的。为了规避这一点，可以使用模板文件，例如src/Makevars.in

PKG_CPPFLAGS = @DWA_INC@
PKG_LIBS = @DWA_LIB@

并编写一个configure脚本来检查环境并src/Makevars根据发现进行创建。configure编写脚本有不同的策略。我通常使用autoconf，例如在RcppArrayFire或dqmagic中。

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