首页 > 解决方案 > 有没有办法在 R 中创建热图,每列都有自己的比例?

问题描述

我正在尝试制作一个热图,其中每列都有自己的矩阵比例,以便每列中的颜色不受其他列的值的影响。然而,据我所知,没有一个主要的软件包提供允许我这样做的选项。

我现在正在使用这个矩阵:

structure(c(37525.6, 38150.7777777778, 54772.3, 76581.6, 89016.8888888889, 
132229.2, 47912.2222222222, 57342.2, 61666.6, 2071694.44444444, 
4640000, 3397239.5, 310529.6, 433809.7, 437263.8, 23828.1, 33041.3, 
47197.3, 19970.4, 11566.4, 14479.1), .Dim = c(3L, 7L), .Dimnames = list(
    c("Nor", "Plac", "Vaso"), c("Tnf", "Il6", "IL8", "IP10", 
    "MCP1", "GCSF", "IL10")))

标签: rdataframematrixheatmap

解决方案


heatmap(as.matrix(data), scale = "column")

或者,如果您更喜欢更好看:

library(dplyr)
data%>%
as.matrix()%>%
heatmap(scale = "column")

scale = "column"内置heatmap()以了解按列着色。


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