inext - iNEXT 置信区间非常小
问题描述
通过将计数数据折叠成所有火灾前和火灾后地块的计数,我已经格式化了 iNEXT 的 138 个成对火灾前和火灾后数据的植被地块的丰度数据。计数以每公顷的数量为单位,因为火灾前和火灾后采样间隔之间的地块大小不同。当我运行 iNEXT 并指定 se=T 和 conf=0.95 时,我最终得到非常小的置信区间,当我使用 ggiNEXT 命令绘制它们时根本不会出现。我写信是想知道我是否做错了什么,或者这些结果是否正确。
计算稀疏/外推曲线 (R/E)
out <- iNEXT(master, q=c(0, 1, 2), se=T,conf = 0.95,datatype="abundance") 出
现在绘制基于样本大小的 R/E 曲线,按“时间步长”分隔
并绘制具有 95% 置信区间的曲线
ggiNEXT(out, type=1, facet.var="order", se=T,color.var="order") + theme_bw(base_size=8)
计算稀疏/外推曲线 (R/E)
out <- iNEXT(master, q=c(0, 1, 2), se=T,conf = 0.95,datatype="abundance") 出
现在绘制基于样本大小的 R/E 曲线,按“时间步长”分隔
并绘制具有 95% 置信区间的曲线
ggiNEXT(out, type=1, facet.var="order", se=T,color.var="order") + theme_bw(base_size=8)
我希望这些 CI 会更大,就像我通过 Rob Colwell 的 EstimateS GUI 软件进行这些分析时一样,在该软件中我能够指定结果,而无需将数据折叠成两列物种计数(pre- vs. post-火)。IE,在 EstimateS 中,我能够使用所有地块的所有地块计数数据来构建稀疏曲线和 CI。知道这些 iNEXT 结果是否合理吗?
解决方案
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