python - 试图在networkx中绘制不可见节点，但得到黑色节点

Question

我想在 networkx 中绘制一个完全不可见的节点。基本上它应该就好像它没有被绘制一样。但是，由于我的代码结构，我不能轻易不绘制它。如果我可以将 设置node_color为类似"Invisible".

由于 networkx 用于matplotlib.pyplot.scatter绘制节点，我想我会像 matplotlib 一样处理它。为此，只需将c特定标记的参数设置为字符串"None"（请参阅Plotting with a transparent marker but non-transparent edge）。

这是一个示例，其中 5 个标记中有 2 个不可见：

plt.scatter(range(5), range(5), c = ["None", "black", 'red', "None", 'blue'])

让我们用networkx试试：

G = nx.erdos_renyi_graph(100,0.03) 
nodelist = list(G.nodes())   
colorlist = ["None" if node%2==0 else "red" for node in nodelist] #even nodes should be invisible
nx.draw_networkx(G, nodelist=nodelist, node_color=colorlist) 

请注意，偶数节点不是不可见的，它们是黑色的。

我不明白，因为当我从networkx查看源代码时，相关行似乎是

node_collection = ax.scatter(xy[:, 0], xy[:, 1],
                             s=node_size,
                             c=node_color,
                             marker=node_shape,
                             cmap=cmap,
                             vmin=vmin,
                             vmax=vmax,
                             alpha=alpha,
                             linewidths=linewidths,
                             edgecolors=edgecolors,
                             label=label)

所以colorlist应该直接发送到scatter没有任何改变。

谁能解释为什么会这样？为什么这些节点变成黑色？

标签： pythonmatplotlibnetworkx

Answer 1

找到问题需要一些时间，但我能够通过以下方式重现networkx行为matplotlib：

pl.scatter(range(5), range(5), c = ["None", "black", 'red', "None", 'blue'], alpha=1.0)

Networkx默认参数alpha=1.0（与alpha=Noneof不同matplotlib）。以下对我有用：

nx.draw_networkx(G, nodelist=nodelist, node_color=colorlist, alpha=None, with_labels=False) 

感谢@Paul Brodersen 的评论：看起来不同的默认值已解决：比较2.3与最新(2.4.xy) 的代码。