python - 在 Python 中使用字符串而不是字节迭代 gzipped 对象

Question

根据文件的扩展名，我使用带有上下文管理器的不同开启器，如下所示：

if args.vcf_in.endswith(".gz"):
    dopenf = gzip.open
    mode = "rb"
else:
    openf = open
    mode = "rt"

不幸的是，当我尝试在一种情况下迭代对象时，它是字节和另一个字符串，并且代码失败：

with openf(args.vcf_in, mode) as fin:
    for line in fin:
        count += 1
        print(line)
        if line.startswith("#"):

有没有办法遍历一个 gzip 文件，以便输出的行是字符串？我知道我可以检查它们是否是字节并对其进行解码，但我很好奇是否有更好的方法使用 opener 或 io 包。

谢谢！

标签： pythongzip

Answer 1

也许我在这里误解了一些东西，但是如果您的 gzip 文件是文本文件，您应该能够简单地调用 gzip.open() 并使用 mode='r'（不是 'rb'）代替标准的 open()。不需要所有的 io 类。