image-segmentation - 加载 nii.zip（压缩）3d 分割文件

Question

我知道 SimpleITK 可以读取 Nifty (.nii) 格式的 3d 图像，并且它支持 nii.gz 压缩版本。但是，我无法加载 nii.zip 文件。如果我尝试直接解压缩/提取这些文件，这些文件会抛出错误，并且 SimpleITK 也不会将它们识别为可读格式之一。

数据集供参考：https ://academictorrents.com/details/27772adef6f563a1ecc0ae19a528b956e6c803ce

标签： image-segmentationnifti

Answer 1

我前段时间下载了相同的数据集，我没有彻底尝试过，但这是我的经验：

1. 我能够成功解压缩 nii.zip 文件

   • 我正在使用 Linux Ubuntu 18.04 并从 GUI 预安装解压缩实用程序
   • 您遇到的问题可能是由于使用了不同的存档管理器，或者数据集在下载过程中可能已损坏
   • 解决方案- 尝试不同的存档管理器并再次下载数据集

2. 我正在使用 Aliza 查看解压缩的扫描

   • 根据我快速检查医学图像格式的经验，Aliza 查看器是可以导出到不同格式的最佳程序

3. 读取压缩文件的解决方案

   • 如果您使用 SimpleITK 或（我在 python 中最喜欢的）Nibabel并想直接读取压缩文件，您可以参考这些答案如何解决读取压缩档案中文件的问题 -堆栈溢出问题 1和堆栈溢出问题 2