r - 想要制作一个 tsne 情节显示子集

Question

我是新手R。我为我的数据“yfp”制作了一个 tsne 图。我的数据中有两个子集（yfppt 和 yfpng）。我想在 yfp tsne 图中显示它们的分布或位置，但失败了。我什至没有设置图例，但问题表明图例中有错误。

我使用 RStudio 运行RaceID 包。

这是我为子集所做的编码：

yfpng<-data2[, 1:55]
yfppt<-data2[, 56:124]

这是我试图在 tsne 图中分配子集的编码：

types <- sub("(\\_\\d+)$","", colnames(yfp@ndata))
subset <- types[grep("yfppt|yfpng",types)]
plotsymbolsmap(yfp,types,subset=subset,fr=TRUE)

图例错误（“topleft”，图例 = 排序（唯一（类型 [fp]）），col = samples_col，：“图例”的长度为 0

我希望在 yfp tsne 图中输出两个子集（yfppt 和 yfpng）的分布，并且有一个图例显示哪些点分别是 yfppt 和 yfpng。

标签： rbioinformatics