r - 大向量 R 的差分矩阵

Question

我有一个大向量（长度：250k）并且想要计算每个元素与所有其他元素的差异。

我在较小尺寸上完成它的一种方法是：

n = 1000
set.seed(35)
values = sample(1:1e3, n, replace=T)
mat_temp = matrix(values, n, n, byrow=TRUE) - matrix(values, n, n, byrow=FALSE)
mat_temp = abs(mat_temp)

这并不理想，因为我只需要对角线的下部（或绝对差异）。

主要问题是：如何有效地为完整的 250k*250k ( n = 250000) 矩阵运行它？使用 16GB RAM，这可能吗？尝试过bigmemory，但无法初始化大矩阵。

有没有办法（我只需要差异）？

标签： rmatrix