r - 在经度和纬度上填充渐变

Question

我有一个包含纬度、经度和辐射的 csv 文件。数据看起来像一个网格，全州大约有 100 个点。我知道那里有很多 R 映射选项，但似乎最容易采用我所拥有的并尝试从点到点制作渐变，所以它看起来像一张热图。我看到的所有热图选项都与密度无关，当我将它们与这些数据一起使用时，它们看起来并不准确。有没有可以用来平滑点之间颜色的功能？

这是一个数字范围小得多的可重现示例：

lat    lon    value
40.5   -91.5  4513619
41.0   -95.5  4490658
41.5   -96.0  4453810
41.5   -94.5  4475373
42.0   -95.5  4432107  
42.0   -94.5  4416015   

ggplot(df, aes(x = lon, y = lat, color = value)) + 
  geom_point(size=8) + 
  coord_equal() + 
  xlab('Longitude') + 
  ylab('Latitude')

标签： rheatmap

Answer 1

我们可以使用geom_tilefromggplot2包来创建一个 heatmep。

library(ggplot2)

ggplot(df, aes(x = lon, y = lat, fill = value)) + 
  geom_tile(color = "black") +
  scale_fill_viridis_c() +
  coord_equal() + 
  xlab('Longitude') + 
  ylab('Latitude') +
  theme_bw() + 
  theme(panel.grid.major = element_blank(),
        panel.grid.minor = element_blank(),
        panel.border = element_blank())

由于您只提供了六个数据点，因此该图看起来很奇怪。下面我完成并扩展了您的示例数据集，然后使用相同的代码绘制数据。

library(dplyr)
library(tidyr)

set.seed(123)

df2 <- df %>%
  complete(lat, lon = seq(-96, -91.5, by = 0.5)) %>%
  mutate(value = ifelse(is.na(value), sample(df$value, n(), replace = TRUE), value))

ggplot(df2, aes(x = lon, y = lat, fill = value)) + 
  geom_tile(color = "black") +
  scale_fill_viridis_c() +
  coord_equal() + 
  xlab('Longitude') + 
  ylab('Latitude') +
  theme_bw() + 
  theme(panel.grid.major = element_blank(),
        panel.grid.minor = element_blank(),
        panel.border = element_blank())

最后，由于您使用的是空间数据集，因此我们只需将数据转换为栅格并使用mapview包进行绘制。

library(sp)
library(sf)
library(raster)
library(mapview)

df_sp <- df2 %>%
  st_as_sf(coords = c("lon", "lat"), crs = 4326) %>%
  as("Spatial") 

r <- raster(ncol = 10, nrow = 4)
extent(r) <- extent(df_sp)
r <- rasterize(df_sp, r, df_sp$value)

mapview(r)

数据

df <- read.table(text = "lat    lon    value
40.5   -91.5  4513619
41.0   -95.5  4490658
41.5   -96.0  4453810
41.5   -94.5  4475373
42.0   -95.5  4432107  
42.0   -94.5  4416015",
                 header = TRUE)