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python - 如何在图表中标记特定类型（例如 030T）的所有三元组？

问题描述

我有一个数据框 df ：

Source, Target
aaaa, bbbb
aaaa, cccc
aaaa, dddd
bbbb, cccc
cccc, dddd

等等。

文件“total_edges.csv”（71kb）：https ://uni-duisburg-essen.sciebo.de/s/WLDD4ytkjekVcIL

我得到一个图形对象，并且根据 github 问题跟踪器（https://github.com/igraph/python-igraph/issues/253）三元组节点/边缘，但它失败了：

import pandas as pd
import igraph as ig

df_edges = pd.read_csv("total_edges.csv")

g = ig.Graph.TupleList(df_edges.itertuples(index=False), directed=True)
tc = g.triad_census()
ffl = ig.Graph.Formula("A --> B --> C, A --> C")
result = g.get_subisomorphisms_lad(ffl, induced=True)
print(result)

错误消息（带有更新的 Pop_OS x64、Python 3.7.5 的 VM）：

Traceback (most recent call last):
  File "count_triads.py", line 20, in <module>
    ffl = ig.Graph.Formula("A --> B --> C, A --> C")
  File "/home/admin/.local/lib/python3.7/site-packages/igraph/formula.py", line 209, in construct_graph_from_formula
    for start_names, end_names, arrowheads in generate_edges(part):
  File "/home/admin/.local/lib/python3.7/site-packages/igraph/formula.py", line 90, in generate_edges
    raise SyntaxError(msg)
SyntaxError: invalid token found in edge specification: A --> B --> C

如何使用三元组类型 030T 的三元组值（A、B、C、无）标记该图中的所有节点，以便我可以以不同的方式过滤/绘制三元组和非三元组？

标签： pythonigraphsna

解决方案

关于该错误，您似乎在公式解析器中遇到了与此问题类似的问题。

尝试应用最近的更改或安装 python-igraph 的开发版本可能会有所帮助。

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