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r - 从子目录复制许多文件

问题描述

我正在尝试将文件从许多子目录复制/移动到一个文件夹中：

new.folder <- "path/to/new/folder"
files <- basename(list.files(path, recursive = T))
file.copy(from=files, to=new.folder)

不幸的是，我遇到了所有文件的错误：

In file.copy(from = files, to = new.folder):
  problem copying ./E202.fastq.gz to /path/to/new/folder/E202.fastq.gz: No such file or directory

我会很感激任何帮助，我是 R 的新手。

标签： rfilecopymovesubdirectory

解决方案

确保所有文件都存在：

all(file.exists(files))

否则，使用full.names = TRUE

files <- list.files(path, recursive = TRUE, full.names = TRUE)

因为如果你不这样做，文件将被假定在当前目录中

getwd()

这可能或可能不等同于path

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