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data-visualization - 用于可视化分层网络和评估从网络中移除节点的影响的工具

问题描述

一直在使用 NetworkX 来可视化从系统到系统的数据流。这很好用，但可视化似乎有点乏味，另外我想与网络交互，做一些事情，比如删除节点或“检查”节点。我也尝试过 Power BI 和 Gephi 等工具，但它们都有问题。

有哪些 BI 工具/Python 库等可以有效地可视化有向网络图并与之交互？

标签： data-visualizationnetworkxhierarchy

解决方案

您有两个问题应该分开处理：可视化和交互性。

可视化：

NetworkX 有一些工具可以有效地可视化层次图。他们正在使用Graphviz库和pygraphviz/pydot接口。这是示例：

import networkx as nx

# Create the hierarchical graph (DAG)
G = nx.fast_gnp_random_graph(70, 0.02)
G.remove_edges_from([(x, y) for (x, y) in G.edges if x > y])
G = nx.subgraph(G, max(nx.connected_components(G), key=lambda x: len(x)))

# Draw it with default function
nx.draw(G, node_size=50)

在此处输入图像描述

# Draw it with graphviz_layout
nx.draw(G, node_size=50, pos=nx.nx_agraph.graphviz_layout(G, prog='dot'))

在此处输入图像描述

如果您想使用 Graphviz 本身可视化您的图形，您可以将其转换为 DOT 文件并在以后使用 Graphviz 的全部功能。

您还可以使用Bokeh或D3.js等 Javascript 库以更具交互性的方式绘制 NetworkX 图（您可以交互地选择节点、突出显示边缘以及这些库中的更多内容）。

互动性：

这个问题远比可视化问题复杂。Python 没有稳定的流行库/程序可以让您在交互式 GUI 中操作图形。交互性需要非常复杂的软件，而 Python 没有。

最适合您的软件是：

  • Gephi（它没有层次图的默认可视化，但你可以下载一个插件来实现它）。
  • Cytoscape - 也许它比 Gephi 更适合你。
  • Wolfram Mathematica - 不错，但要花钱。

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