python - PyMC3：每次都给出不同的结果

Question

我已经定义了一个对数似然函数，并且我有一个变量在均匀分布上进行采样。我确保对数似然函数为相同的输入返回相同的结果。但是当我采样时，每次分布都有些不同（在相同的范围内）。

到底是怎么回事？

import pymc3 as mc
import theano.tensor as tt

SAMPLES = 1000
TUNING_SAMPLES = 100
N_CORES = 10
N_CHAINS = 2

#(logl_ThetaFromChoices is defined above with the input)

# use PyMC3 to sampler from log-likelihood
with mc.Model() as modelFindTheta:
    theta = mc.Uniform('theta', lower=-200.0, upper=200.0)

    # convert m and c to a tensor vector
    theta = tt.as_tensor_variable(theta)

    def callOp(v):
        return logl_ThetaFromChoices(v)
    mc.DensityDist('logl_ThetaFromChoices', callOp, observed={'v': theta})

    step1 = mc.Metropolis()
    trace_theta = mc.sample(SAMPLES,
                            tune=TUNING_SAMPLES,
                            discard_tuned_samples=True,
                            chains=N_CHAINS,
                            cores=N_CORES,
                            step=step1)

'alpha' == 这里的 Theta

标签： pythonpymc3markov-chainsmcmc

Answer 1

由于它涉及随机数生成，因此需要设置种子以获得可重复的结果。对于 PyMC3，这是通过pymc3.sampling.sample() 方法random_seed中的参数完成的。