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python - 为什么我在 python 的 spearman 相关中得到 nan

问题描述

我scipy用来计算相关性。我计算斯皮尔曼相关性的代码如下。

from scipy import stats
sequence_1 = [1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0]
sequence_2 = [0, 0.009783728115345005, 0, 0, 0.0019759230121848587, 0.0007535430349118562, 0.0002661781514710257, 0, 0, 0.0007835762419683435]
myspearman = stats.spearmanr(sequence_1,sequence_2)
print(myspearman)

我从代码中得到以下结果。

SpearmanrResult(correlation=nan, pvalue=nan)

尽管这个主题中有一些 SO 问题，但它们并没有专门回答我的问题。

我的问题如下。

如果需要，我很乐意提供更多详细信息。

标签： pythonscipy

解决方案

为什么spearmanr输出 a NaN？

没有变化，sequence_1因此它的标准偏差等于 0，这将导致spearmanr()函数中的零除，从而返回 a NaN。

在这种情况下，等效值是NaN多少？

从数学上讲，当两个列表之一中的标准差等于 0 时（其中随机变量的所有实例都采用完全相同的值） ，Spearman 相关系数是未定义的。我建议您研究这里的公式， 以更好地理解为什么如果这不简单！

有没有办法避免这种情况并在 Python 中获取实际值？

由于实际值未定义，因此您确实可以使用 a 获得正确的值NaN。但是，您可能希望依赖其他公式来解决此类问题，例如两个变量之间的协方差 - 在这种情况下，协方差将等于零。

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